RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YIN7	160 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPR1	P16066	1061 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	UTRN	P46939	3433 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6	9e-8	■□□□□ 8.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRND	Q07001	517 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	AACS	Q86V21	672 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF5L	O75529	589 aa		11.27	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE8B	O95263	885 aa		11.27	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.27	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.27	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JLW4	131 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	BBOX1	O75936	387 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNAP23	O00161	211 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM10	P62072	90 aa		11.27	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GUL7	405 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPEP1	P16444	411 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	MX1	P20591	662 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNA3	P22001	575 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGFB2	P61812	414 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF609	O15014	1411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE1A	P54750	535 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGFR2	P21802	821 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADORA1	P30542	326 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	LPIN2	Q92539	896 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	XDH	P47989	1333 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPSM2	P81274	684 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNJ4	P48050	445 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC5A1	P13866	664 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLRK1	P26718	216 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	C21orf2	O43822	256 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.2	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms