RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SHTN1A0MZ66 631 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 NTSR2O95665 410 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 MICALL2Q8IY33 904 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 CSRNP1Q96S65 589 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 NECTIN2Q92692 538 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 BBOX1O75936 387 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 SP8Q8IXZ3 490 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 MPNDQ8N594 471 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-214ENST00000592483 PDIA6Q15084 440 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 DPF2Q92785 391 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC4O15439 1325 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF16BQ96L93 1317 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A2P04920 1241 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A3P09131 477 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A5Q5PT55 438 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 YDJCA8MPS7 323 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP10Q53GL7 1025 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-214ENST00000592483 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-214ENST00000592483 MYL6BP14649 208 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 PROSER3Q2NL68 480 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRCP08575 1304 aa29.95■■■□□ 2.38
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CAPNS1-214ENST00000592483 FLIIQ13045 1269 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD14O00487 310 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-214ENST00000592483 ANXA1P04083 346 aa29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
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CAPNS1-214ENST00000592483 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.85■■■□□ 2.37
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CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 CDCA5Q96FF9 252 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 FKBP1BP68106 108 aa29.83■■■□□ 2.37
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CAPNS1-214ENST00000592483 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D8O95759 1140 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.82■■■□□ 2.36
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CAPNS1-214ENST00000592483 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 RTL9Q8NET4 1388 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR25O00155 361 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMBP2O15034 1052 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM27P14373 513 aa29.77■■■□□ 2.36
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