RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-210	ENST00000591994	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	MMP20	O60882	483 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	LGR5	O75473	907 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	OCLN	Q16625	522 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.66	6e-12	■■■■■ 51.5
RPRD1A-210	ENST00000591994	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994		Q6ZS46	218 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PRMT3	O60678	531 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	STIM2	Q9P246	746 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994		J3QW42	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CDC27	P30260	824 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PCSK2	P16519	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	WNT8B	Q93098	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	KIF4A	O95239	1232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	FST	P19883	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZAP70	P43403	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PTPRA	P18433	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	SCNN1A	P37088	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CABP4	P57796	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPRD1A-210	ENST00000591994	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	COBL	O75128	1261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	GLB1	P16278	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ARL4D	P49703	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CEP120	Q8N960	986 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FSCN2	O14926	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	GRIK1	P39086	918 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ALX3	O95076	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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