RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMD14O00487 310 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 CRHR2Q13324 411 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRYD7Q5W111 196 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 TDHQ8IZJ6 230 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.33■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MIER1Q8N108 512 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 22.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 LGR6Q9HBX8 967 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 A1BGP04217 495 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 GJA8P48165 433 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC12Q96J65 1359 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 POTEB2H3BUK9 544 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM161BQ96MY7 647 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.29■□□□□ 0.04
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CAPNS1-209ENST00000590049 NF2P35240 595 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SCARF1Q14162 830 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MTFR1Q15390 333 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 POLKQ9UBT6 870 aa15.29■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 GJB1P08034 283 aa15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NYXQ9GZU5 481 aa15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CCER2I3L3R5 266 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.24■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP2R1AP30153 589 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP53Q96M91 514 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MRS2Q9HD23 443 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SP8Q8IXZ3 490 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 NECTIN2Q92692 538 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF208Q9H0X6 261 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 NCOR1O75376 2440 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL5P13501 91 aa15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PRMT2P55345 433 aa15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GNRH1P01148 92 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PRKG1Q13976 671 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF790Q6PG37 636 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 WNK4Q96J92 1243 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RTL9Q8NET4 1388 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 BBOX1O75936 387 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC4O15439 1325 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF22Q14807 665 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 HLFQ16534 295 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 WASHC4Q2M389 1173 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ECE2O60344 883 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPN18Q99952 460 aa15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SGPL1O95470 568 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CAPN2P17655 700 aa15.16■□□□□ 0.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.16■□□□□ 0.02
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