RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 COG6Q9Y2V7 657 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 LTBP1Q14766 1721 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNAI2P04899 355 aa26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE3AQ14432 1141 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLLQ9UGP5 575 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 C6orf229H3BNL8 230 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-208ENST00000566515 XDHP47989 1333 aa26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 AOC3Q16853 763 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL4A5P29400 1685 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPIP5K2O43314 1243 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 UFL1O94874 794 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHRNDQ07001 517 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 GGA1Q9UJY5 639 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1B0GUL6 1792 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.17■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIMBP2O15034 1052 aa26.16■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 WASHC4Q2M389 1173 aa26.16■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.16■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRGAP3O43295 1099 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF5LO75529 589 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC24Q50LG9 513 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 JDP2Q8WYK2 163 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS33BQ9H267 617 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2B4P23634 1241 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTX1Q13505 466 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 EYA3Q99504 573 aa26.14■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIL1Q9H173 461 aa26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNAP23O00161 211 aa26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 NIM1KQ8IY84 436 aa26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNJ4P48050 445 aa26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 FZD9O00144 591 aa26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 EYA2O00167 538 aa26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 DOK7Q18PE1 504 aa26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP8B2P98198 1209 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL24Q5JXM2 366 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 COPRSQ9NQ92 184 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRK1P26718 216 aa26.08■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.08■■□□□ 1.77
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLTPD2A6NH11 291 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP85Q6P2H3 762 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED23Q9ULK4 1368 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 G3V3G9 751 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 CIAO1O76071 339 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLA2Q14181 598 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECE2O60344 883 aa26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSH3Q8TE77 659 aa26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO3Q9UK99 471 aa26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 YDJCA8MPS7 323 aa26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE8BO95263 885 aa26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD17O75943 681 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRBNQ96SW2 442 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCN9AQ15858 1988 aa26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL9Q07325 125 aa26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE4AQ14139 1066 aa26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms