RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PPIP5K2O43314 1243 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PANK1Q8TE04 598 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 POLLQ9UGP5 575 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 C6orf229H3BNL8 230 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 RIMBP2O15034 1052 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 UFL1O94874 794 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 XDHP47989 1333 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 CHRNDQ07001 517 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 NMRK2Q9NPI5 230 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GGA1Q9UJY5 639 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GLTPD2A6NH11 291 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 FZD9O00144 591 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 SNAP23O00161 211 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 TAF5LO75529 589 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GNAI3P08754 354 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 KLRK1P26718 216 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 NIM1KQ8IY84 436 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 MED23Q9ULK4 1368 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 YDJCA8MPS7 323 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ATP2B4P23634 1241 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 DOK7Q18PE1 504 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 WASHC4Q2M389 1173 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 LRRC24Q50LG9 513 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 JDP2Q8WYK2 163 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ECE2O60344 883 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 GNAI2P04899 355 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 EYA3Q99504 573 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 SIL1Q9H173 461 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 VPS33BQ9H267 617 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 RRAGCQ9HB90 399 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 COG6Q9Y2V7 657 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-211ENST00000548041 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 POTECB2RU33 542 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 KIF3CO14782 793 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 RAD17O75943 681 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 SRGAP3O43295 1099 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 KCNJ4P48050 445 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 CXCL9Q07325 125 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 MTX1Q13505 466 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 ZNRF3Q9ULT6 936 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 PSMD14O00487 310 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 MS4A1P11836 297 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 METTL24Q5JXM2 366 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 GPC2Q8N158 579 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-211ENST00000548041 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.5 ms