RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF5LO75529 589 aa28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 STYK1Q6J9G0 422 aa28.12■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 LNPKQ9C0E8 428 aa28.12■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL24Q5JXM2 366 aa28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CIAO1O76071 339 aa28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TGFB2P61812 414 aa28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH1B1P30837 517 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNDQ07001 517 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB11FIP3O75154 756 aa28.09■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 BBOX1O75936 387 aa28.09■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NUCB1Q02818 461 aa28.09■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.08■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CNKSR1Q969H4 720 aa28.08■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.08■■■□□ 2.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.07■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL6Q8N841 843 aa28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LRP5O75197 1615 aa28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMM10P62072 90 aa28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PIM2Q9P1W9 311 aa28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO3Q9UK99 471 aa28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UTRNP46939 3433 aa28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C21orf2O43822 256 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GPSM2P81274 684 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT17Q9BSW7 474 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE8BO95263 885 aa28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE4AP27815 886 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 AACSQ86V21 672 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SPEF2Q9C093 1822 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TNNI3KQ59H18 835 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SP8Q8IXZ3 490 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.02■■■□□ 2.08
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.01■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.01■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.01■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 BCS1LQ9Y276 419 aa28■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KLRK1P26718 216 aa28■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ADORA1P30542 326 aa28■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1B0GUL7 405 aa27.99■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 RGS3P49796 1198 aa27.99■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP2B3Q16720 1220 aa27.99■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SLX4Q8IY92 1834 aa27.99■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.99■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.98■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.97■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ4P48050 445 aa27.97■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 POLLQ9UGP5 575 aa27.97■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 XDHP47989 1333 aa27.96■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FGFR2P21802 821 aa27.96■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TMC4Q7Z404 712 aa27.96■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 UFL1O94874 794 aa27.95■■■□□ 2.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 MPNDQ8N594 471 aa27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 XAGE2Q96GT9 111 aa27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.94■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf229H3BNL8 230 aa27.94■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF609O15014 1411 aa27.94■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 LPIN2Q92539 896 aa27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR108Q9NPR9 543 aa27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 GGA1Q9UJY5 639 aa27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNA1SQ13698 1873 aa27.92■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 GYG1P46976 350 aa27.91■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.91■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.91■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A1P13866 664 aa27.91■■■□□ 2.06
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE4AQ14139 1066 aa27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms