RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.8■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 COL4A5P29400 1685 aa24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 C6orf229H3BNL8 230 aa24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 PPIP5K2O43314 1243 aa24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 AOC3Q16853 763 aa24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.78■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 UFL1O94874 794 aa24.77■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.77■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 XDHP47989 1333 aa24.77■■□□□ 1.56
HLA-B-255ENST00000498007 GNAI2P04899 355 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 POLLQ9UGP5 575 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 GGA1Q9UJY5 639 aa24.76■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.75■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.75■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.75■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 COG6Q9Y2V7 657 aa24.75■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 CHRNDQ07001 517 aa24.74■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 JDP2Q8WYK2 163 aa24.74■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.74■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 RIMBP2O15034 1052 aa24.73■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 EYA3Q99504 573 aa24.73■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ATP2B4P23634 1241 aa24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 WASHC4Q2M389 1173 aa24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 NIM1KQ8IY84 436 aa24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.72■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 PDE3AQ14432 1141 aa24.71■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 VPS33BQ9H267 617 aa24.71■■□□□ 1.55
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 SRGAP3O43295 1099 aa24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 TAF5LO75529 589 aa24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 KCNJ4P48050 445 aa24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.7■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC24Q50LG9 513 aa24.69■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 SIL1Q9H173 461 aa24.69■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 MTX1Q13505 466 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 MED23Q9ULK4 1368 aa24.67■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 FZD9O00144 591 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 SNAP23O00161 211 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DOK7Q18PE1 504 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 METTL24Q5JXM2 366 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.66■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 GLTPD2A6NH11 291 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 G3V3G9 751 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 EYA2O00167 538 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.65■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 ECE2O60344 883 aa24.64■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 KLRK1P26718 216 aa24.64■■□□□ 1.54
HLA-B-255ENST00000498007 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.63■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 WDR90Q96KV7 1748 aa24.62■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.62■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 COPRSQ9NQ92 184 aa24.62■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 YDJCA8MPS7 323 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 RAD17O75943 681 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 CEP85Q6P2H3 762 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.61■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 CIAO1O76071 339 aa24.6■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 ATP8B2P98198 1209 aa24.6■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 SCN9AQ15858 1988 aa24.6■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 CXCL9Q07325 125 aa24.59■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 GPC2Q8N158 579 aa24.59■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.59■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 RRAGCQ9HB90 399 aa24.59■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 FBXO3Q9UK99 471 aa24.59■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 PDE8BO95263 885 aa24.58■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.58■■□□□ 1.53
HLA-B-255ENST00000498007 SSH3Q8TE77 659 aa24.58■■□□□ 1.53
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