RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 PRELPP51888 382 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 XDHP47989 1333 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 C6orf229H3BNL8 230 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 MTX1Q13505 466 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 VPS33BQ9H267 617 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 GGA1Q9UJY5 639 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 SRGAP3O43295 1099 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 ATP2B4P23634 1241 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 YY1P25490 414 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 CHRNDQ07001 517 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 POLLQ9UGP5 575 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 PPIP5K2O43314 1243 aa22.77■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 UFL1O94874 794 aa22.77■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 EYA3Q99504 573 aa22.77■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTX4-202ENST00000440447 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.76■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.76■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 ATP8B2P98198 1209 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 AOC3Q16853 763 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 WASHC4Q2M389 1173 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 JDP2Q8WYK2 163 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 CHD4Q14839 1912 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 EYA2O00167 538 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 KCNJ4P48050 445 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 LRRC24Q50LG9 513 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 COPRSQ9NQ92 184 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 FBXO3Q9UK99 471 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 SPEF2Q9C093 1822 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 RIMBP2O15034 1052 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 TAF5LO75529 589 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 SIL1Q9H173 461 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 METTL24Q5JXM2 366 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 CEP85Q6P2H3 762 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 NIM1KQ8IY84 436 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 SBF1O95248 1867 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 CIAO1O76071 339 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 SSH3Q8TE77 659 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-202ENST00000440447 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 G3V3G9 751 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 POLA2Q14181 598 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 CRBNQ96SW2 442 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 LTBP1Q14766 1721 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.69■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 MED23Q9ULK4 1368 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 FZD9O00144 591 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 UBE4AQ14139 1066 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 SNAP23O00161 211 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 PDE8BO95263 885 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 DOK7Q18PE1 504 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 HMMRO75330 724 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 COL4A5P29400 1685 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 GLTPD2A6NH11 291 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 ECE2O60344 883 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTX4-202ENST00000440447 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 KLRK1P26718 216 aa22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.64■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.63■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.63■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 COA1Q9GZY4 146 aa22.63■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms