RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 RGMBQ6NW40 437 aa22.33■■□□□ 1.17
NICN1-204ENST00000436744 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.33■■□□□ 1.17
NICN1-204ENST00000436744 RALBP1Q15311 655 aa22.32■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.32■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.31■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 GGA3Q9NZ52 723 aa22.31■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.3■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 EYA3Q99504 573 aa22.3■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 UFL1O94874 794 aa22.29■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 RUNDC1Q96C34 613 aa22.29■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 MBIPQ9NS73 344 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 HYPKQ9NX55 129 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 TRPA1O75762 1119 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 HOXB7P09629 217 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 CDCA5Q96FF9 252 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 MYD88Q99836 296 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 RNF186Q9NXI6 227 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-204ENST00000436744 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 SULF1Q8IWU6 871 aa22.26■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.26■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 SLC10A3P09131 477 aa22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 SOX10P56693 466 aa22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 CCDC102AQ96A19 550 aa22.25■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 G3V3G9 751 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 SCARF1Q14162 830 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 CSRNP1Q96S65 589 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 GGA1Q9UJY5 639 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.24■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 GOLGA2Q08379 1002 aa22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 MOB2Q70IA6 237 aa22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.23■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 PSME4Q14997 1843 aa22.21■■□□□ 1.15
NICN1-204ENST00000436744 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.2■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 MXD3Q9BW11 206 aa22.2■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 ZNF853P0CG23 659 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 SPEF2Q9C093 1822 aa22.19■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 PDE8AO60658 829 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 GMLQ99445 158 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.18■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 XDHP47989 1333 aa22.17■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 USP17L8P0C7I0 530 aa22.17■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.17■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 ZNF609O15014 1411 aa22.16■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.16■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.16■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.16■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 USP17L3A6NCW0 530 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 USP17L4A6NCW7 530 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 APAF1O14727 1248 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NICN1-204ENST00000436744 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 FBXW7Q969H0 707 aa22.14■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 IFT57Q9NWB7 429 aa22.14■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 ATP2B4P23634 1241 aa22.13■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.13■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 TBC1D8O95759 1140 aa22.12■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 CTSWP56202 376 aa22.12■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 TSPYL6Q8N831 410 aa22.12■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 GREM2Q9H772 168 aa22.12■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 IGKV5-2P06315 115 aa22.11■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 GNAI1P63096 354 aa22.11■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 PODNQ7Z5L7 613 aa22.11■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.11■■□□□ 1.13
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