RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.85	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.85	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	AOC3	Q16853	763 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.19
UBXN7-205	ENST00000429160	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	UFL1	O94874	794 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	MS4A1	P11836	297 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.83	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.82	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.82	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.82	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.82	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	GNAI3	P08754	354 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	POTEC	B2RU33	542 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160		G3V3G9	751 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	DPF2	Q92785	391 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ECE2	O60344	883 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	HSPA6	P17066	643 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	EPHX2	P34913	555 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	APLP1	P51693	650 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CHRND	Q07001	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	CXCL9	Q07325	125 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	KCNJ4	P48050	445 aa		13.77	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.77	□□□□□ -0.2
UBXN7-205	ENST00000429160	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM27	P14373	513 aa		13.77	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB22	O15209	634 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	CIAO1	O76071	339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	SCNN1D	P51172	638 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	MTX1	Q13505	466 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	SCN9A	Q15858	1988 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160		H7C1D1	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	BCAR3	O75815	825 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	PSMD14	O00487	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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