RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 EYA3Q99504 573 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 GGA1Q9UJY5 639 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 TNNQ9UQP3 1299 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 XDHP47989 1333 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 RIMBP2O15034 1052 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 UFL1O94874 794 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 LTBP1Q14766 1721 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 ATP2B4P23634 1241 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 POTECB2RU33 542 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 C1QTNF8P60827 252 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 GPC2Q8N158 579 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 WDR90Q96KV7 1748 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 SPEF2Q9C093 1822 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 CHRNDQ07001 517 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 MEIS3Q99687 375 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 TOMM70O94826 608 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 CXCL9Q07325 125 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 DOK7Q18PE1 504 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 YDJCA8MPS7 323 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 G3V3G9 751 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 ECE2O60344 883 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 RAD17O75943 681 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 GNAI3P08754 354 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 TAF5LO75529 589 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ4P48050 445 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 TNIP1Q15025 636 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 HACL1Q9UJ83 578 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 MED23Q9ULK4 1368 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-205ENST00000426683 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 PLIN1O60240 522 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 SCNN1DP51172 638 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 SNAP23O00161 211 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 RLBP1P12271 317 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 KLRK1P26718 216 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 PSMD14O00487 310 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 EPHX2P34913 555 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 LRRC24Q50LG9 513 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 PODNQ7Z5L7 613 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 GNAI2P04899 355 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 EPS15P42566 896 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 SCN4AP35499 1836 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-205ENST00000426683 POTEIP0CG38 1075 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 POTEJP0CG39 1038 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 FSTL1Q12841 308 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 METTL24Q5JXM2 366 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 PANK1Q8TE04 598 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 COA1Q9GZY4 146 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 EYA2O00167 538 aa22.5■■□□□ 1.19
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