RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317371.8

SSUH2-201, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SSUH2, Length 2,561 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2-201ENST00000317371 NECTIN1Q15223 517 aa14.64□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.64□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.64□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 XAGE2Q96GT9 111 aa14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.63□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 FOSBP53539 338 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 HAUS7Q99871 368 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 M0R2C6 588 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CTSWP56202 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 METTL24Q5JXM2 366 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.62□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TOM1O60784 492 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 ZAP70P43403 619 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 ME3Q16798 604 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 MAP4K1Q92918 833 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 ANAPC15P60006 121 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 HAND2P61296 217 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 GORABQ5T7V8 394 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 GBP4Q96PP9 640 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.61□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PTMSP20962 102 aa14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CYP21A2P08686 494 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 MYH3P11055 1940 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 MAST3O60307 1309 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 MCAMP43121 646 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 PHKA1P46020 1223 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CUL4AQ13619 759 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 GPT2Q8TD30 523 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 OSBP2Q969R2 916 aa14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSUH2-201ENST00000317371 CAMTA2O94983 1202 aa14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 PHF14O94880 888 aa14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 FERMT3Q86UX7 667 aa14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 CSF1RP07333 972 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ATP2B3Q16720 1220 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 FOXP2O15409 715 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 WASHC4Q2M389 1173 aa14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 USP21Q9UK80 565 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 JAK2O60674 1132 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 GJB2P29033 226 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.56□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 LAMA4Q16363 1823 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 BRD1O95696 1058 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SSUH2-201ENST00000317371 INCENPQ9NQS7 918 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms