RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.92■■□□□ 1.26
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CABP1-201ENST00000288616 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.91■■□□□ 1.26
CABP1-201ENST00000288616 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CABP1-201ENST00000288616 G3V3G9 751 aa22.9■■□□□ 1.26
CABP1-201ENST00000288616 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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CABP1-201ENST00000288616 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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CABP1-201ENST00000288616 ZNF853P0CG23 659 aa22.87■■□□□ 1.25
CABP1-201ENST00000288616 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.87■■□□□ 1.25
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CABP1-201ENST00000288616 GGA1Q9UJY5 639 aa22.86■■□□□ 1.25
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CABP1-201ENST00000288616 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.84■■□□□ 1.25
CABP1-201ENST00000288616 IFT57Q9NWB7 429 aa22.84■■□□□ 1.25
CABP1-201ENST00000288616 GGA3Q9NZ52 723 aa22.84■■□□□ 1.25
CABP1-201ENST00000288616 PDE8AO60658 829 aa22.83■■□□□ 1.25
CABP1-201ENST00000288616 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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CABP1-201ENST00000288616 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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CABP1-201ENST00000288616 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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CABP1-201ENST00000288616 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.77■■□□□ 1.24
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CABP1-201ENST00000288616 RGS19P49795 217 aa22.76■■□□□ 1.23
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CABP1-201ENST00000288616 RNF186Q9NXI6 227 aa22.76■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.75■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 USP17L3A6NCW0 530 aa22.75■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 USP17L4A6NCW7 530 aa22.75■■□□□ 1.23
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CABP1-201ENST00000288616 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.75■■□□□ 1.23
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CABP1-201ENST00000288616 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.75■■□□□ 1.23
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CABP1-201ENST00000288616 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.72■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.72■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 GREM2Q9H772 168 aa22.72■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.72■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.71■■□□□ 1.23
CABP1-201ENST00000288616 MOB2Q70IA6 237 aa22.71■■□□□ 1.23
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