RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 HOGA1Q86XE5 327 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 OR2L2Q8NH16 312 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 M1APQ8TC57 530 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SLCO2A1Q92959 643 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PEX13Q92968 403 aa4.61□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 MED30Q96HR3 178 aa4.61□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 MEMO1Q9Y316 297 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF24P17028 368 aa4.6□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 FCGR2CP31995 323 aa4.6□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.6□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SVILO95425 2214 aa4.6□□□□□ -1.67
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CCL20-201ENST00000358813 BDH1Q02338 343 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PRPSAP1Q14558 356 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PDK2Q15119 407 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 UNC50Q53HI1 259 aa4.59□□□□□ -1.67
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