RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 BCL6P41182 706 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 USP53Q70EK8 1073 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 MED9Q9NWA0 146 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 E9PQ18 207 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ADAP1O75689 374 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 NDUFS1P28331 727 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 Q3ZCU0 254 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 PXKQ7Z7A4 578 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 SPACA5Q96QH8 159 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 A0A1W2PPE2 198 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 AGR2O95994 175 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 GPR89BP0CG08 455 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 CLDN6P56747 220 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 RHEBQ15382 184 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 BATFQ16520 125 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 BHLHE40O14503 412 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 CYTIPO60759 359 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 PRNPP04156 253 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 UQCC3Q6UW78 93 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 OR51M1Q9H341 326 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 C4orf47A7E2U8 309 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 RHOP08100 348 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 OR8U9P0C7N5 309 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 LAP3P28838 519 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ACY1Q03154 408 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 TMEM104Q8NE00 496 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 IRF7Q92985 503 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.83□□□□□ -0.03
GPC1-201ENST00000264039 SERTM1A2A2V5 107 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 QDPRP09417 244 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 ABOP16442 354 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 DPP4P27487 766 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 PRRT1Q99946 306 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 RAB33BQ9H082 229 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 STARD5Q9NSY2 213 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 IGLON5A6NGN9 336 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 UMAD1C9J7I0 102 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 AHSA1O95433 338 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CALCBP10092 127 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CD53P19397 219 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 MEP1BQ16820 701 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 AWAT1Q58HT5 328 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 MOB3CQ70IA8 216 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 KIRREL1Q96J84 757 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 SCGNO76038 276 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 HTR2CP28335 458 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 OR2A2Q6IF42 318 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 MARCH3Q86UD3 253 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 DTD2Q96FN9 168 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 LTBP1Q14766 1721 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CXorf65A6NEN9 183 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CLEC3AO75596 197 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CTAG2O75638 210 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 MPIG6BO95866 241 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-201ENST00000264039 CTSLP07711 333 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms