RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 C12orf49Q9H741 205 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A087WXM4 84 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM183AA6NL82 134 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 BHLHE40O14503 412 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 OR7A10O76100 309 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 PPP1R3DO95685 299 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 CD8AP01732 235 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 AGTR1P30556 359 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 AQP2P41181 271 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 FAPQ12884 760 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 FOXF1Q12946 379 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 NEDD8Q15843 81 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 PGGHGQ32M88 737 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 KCTD8Q6ZWB6 473 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 GRINAQ7Z429 371 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2T33Q8NG76 320 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 FBXW5Q969U6 566 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 OTULINQ96BN8 352 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 ARL5BQ96KC2 179 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 LRR1Q96L50 414 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTA-204ENST00000558376 DPRXA6NFQ7 191 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 MCIDASD6RGH6 385 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 IMPA2O14732 288 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TNFSF11O14788 317 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SURF4O15260 269 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 GPRIN2O60269 458 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SYNGR4O95473 234 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 F13BP05160 661 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 CD3EP07766 207 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC159P0C7I6 412 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 MAP2K4P45985 399 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 CXCR4P61073 352 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC35A2P78381 396 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TAB1Q15750 504 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SPARTQ8N0X7 666 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 DUSP21Q9H596 190 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 MED20Q9H944 212 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 FANCFQ9NPI8 374 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 NANSQ9NR45 359 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 GLRX2Q9NS18 164 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 CLN6Q9NWW5 311 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SCN3BQ9NY72 215 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 APOL3O95236 402 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF17P17021 662 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SHC1P29353 583 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 RAC1P63000 192 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ERVK-25P63136 954 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ANK2Q01484 3957 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 PMS2P3Q13401 168 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SYT14P1Q58G82 188 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF773Q6PK81 442 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 KDM8Q8N371 416 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM234Q8WY98 164 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF566Q969W8 418 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A096LNT2 108 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTA-204ENST00000558376 A8MVM7 634 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms