RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.55□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 TAS2R19P59542 299 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 C4orf47A7E2U8 309 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 FAM53BQ14153 422 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 CDC20BQ86Y33 519 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.54□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 PSG6Q00889 435 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GPR18Q14330 331 aa13.53□□□□□ -0.24
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TOP3B-206ENST00000436282 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TMED4Q7Z7H5 227 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MCHR2Q969V1 340 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RAB19A4D1S5 217 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CYR61O00622 381 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3DO95716 219 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 AKR1D1P51857 326 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM229BQ8NBD8 167 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FAM117AQ9C073 453 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 STARD5Q9NSY2 213 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 COMMD9Q9P000 198 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 COL4A2P08572 1712 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SULT1C2O00338 296 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ITGA5P08648 1049 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RAB11BQ15907 218 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM205Q6UW68 189 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SVBPQ8N300 66 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LAMP5Q9UJQ1 280 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RNF222A6NCQ9 220 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 EFCAB7A8K855 629 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 GPR31O00270 319 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 TOMM20Q15388 145 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF141Q15928 474 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 FCRL6Q6DN72 434 aa13.52□□□□□ -0.25
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