RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf100	A8MU93	164 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AIM2	O14862	343 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ND5	P03915	603 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF35	P13682	527 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT1	P15291	398 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB1A	P62820	205 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN2	P80188	198 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2D	Q13557	499 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	HFE	Q30201	348 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MMEL1	Q495T6	779 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	VRK2	Q86Y07	508 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT20	Q8IY31	132 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ST7L	Q8TDW4	575 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A28	Q96A46	364 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2M2	Q96R28	347 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MECR	Q9BV79	373 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51B6	Q9H340	312 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		9.22	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CDHR4	A6H8M9	788 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	UBL3	O95164	117 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV2-5	P01817	119 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LCK	P06239	509 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	DRD4	P21917	467 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CBL	P22681	906 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A3	P33764	101 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	PCGF2	P35227	344 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP4B	P51164	291 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP5	P55064	265 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB39A	Q14964	217 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	USP51	Q70EK9	711 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	UEVLD	Q8IX04	471 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	PANX1	Q96RD7	426 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CDIP1	Q9H305	208 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH20	Q9HBT6	801 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		9.21	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC154	A6NI56	674 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF726	A6NNF4	738 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T1	O43869	369 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CLPTM1	O96005	669 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM153B	P0C7A2	387 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	PRG2	P13727	222 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT1	P18440	290 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB5	P36952	375 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBB2	P43320	205 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	GLO1	Q04760	184 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP4	Q09028	425 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP8	Q14790	479 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	MOG	Q16653	247 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	VMAC	Q2NL98	169 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LEG1	Q6P5S2	330 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	DOK3	Q7L591	496 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM123	Q8N131	208 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	MIER2	Q8N344	545 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		9.2	□□□□□ -0.94
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL17	Q92583	94 aa		9.2	□□□□□ -0.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms