RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 EGR3Q06889 387 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 CAMK2DQ13557 499 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 PTGR1Q14914 329 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 ESCO2Q56NI9 601 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 ITPKCQ96DU7 683 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 LRR1Q96L50 414 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 EMC6Q9BV81 110 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 RLIMQ9NVW2 624 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-208ENST00000547298 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 H3BQF6 201 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 CFLARO15519 480 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 TGDSO95455 350 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 SNAP29O95721 258 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 HPRP00739 348 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GKN3PP0CG01 181 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 LSP1P33241 339 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 IER3P46695 156 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 BPIFB3P59826 476 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 BTG1P62324 171 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 PMS2P3Q13401 168 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MOGQ16653 247 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GALNTL6Q49A17 601 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 NATD1Q8N6N6 113 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 STK35Q8TDR2 534 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MECRQ9BV79 373 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 EMCNQ9ULC0 261 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MS4A18H0YCH9 400 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 CRCPO75575 148 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GSTA1P08263 222 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 NEFHP12036 1026 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 PRG2P13727 222 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 FGF12P61328 243 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 HERPUD1Q15011 391 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 COX20Q5RI15 118 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ANKFN1Q8N957 763 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 CFHR4Q92496 578 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 TXNDC15Q96J42 360 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 M0R082 166 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 AHSA1O95433 338 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 AGR2O95994 175 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 DRD4P21917 467 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GCAP28676 217 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 PHBP35232 272 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 SYPL1Q16563 259 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GPAT3Q53EU6 434 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 THEM4Q5T1C6 240 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 GPR157Q5UAW9 335 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 CADM2Q8N3J6 435 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 FITM2Q8N6M3 262 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-208ENST00000547298 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms