RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRP72O76094 671 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDCD3Q8IVD9 361 aa2.23□□□□□ -2.05
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF607Q96SK3 696 aa2.23□□□□□ -2.05
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf66A4D0T2 115 aa2.2□□□□□ -2.06
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAMP5O95183 116 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.2□□□□□ -2.06
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCK1P16333 377 aa2.2□□□□□ -2.06
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDZK1Q5T2W1 519 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHDDSQ86SQ9 333 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIMKLAQ8IXN7 391 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPAL2Q9H841 368 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLE4Q9NR33 117 aa2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCT3P49368 545 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERCC8Q13216 396 aa2.19□□□□□ -2.06
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