RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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PTX4-201ENST00000293922 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.19■□□□□ 0.18
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PTX4-201ENST00000293922 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.18■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.18■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 RASD1Q9Y272 281 aa16.18■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 MCIDASD6RGH6 385 aa16.17■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 BHLHE40O14503 412 aa16.17■□□□□ 0.18
PTX4-201ENST00000293922 VAMP5O95183 116 aa16.17■□□□□ 0.18
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