RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.02	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FPR3	P25089	353 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TIMP3	P35625	211 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	IFNGR2	P38484	337 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021		Q96M85	177 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RERGL	Q9H628	205 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.01	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SEC14L2	O76054	403 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC2A10	O95528	541 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FCGR2A	P12318	317 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PTGER4	P35408	488 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	OXGR1	Q96P68	337 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	INIP	Q9NRY2	104 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRT84	Q9NSB2	600 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021		A1L4Q6	167 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021		M0R3G1	203 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	NRG4	Q8WWG1	115 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RASD1	Q9Y272	281 aa		12	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1B0GUH1	482 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	UPK3A	O75631	287 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	BCL10	O95999	233 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CTSS	P25774	331 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	NOS3	P29474	1203 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FMOD	Q06828	376 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FN3K	Q9H479	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	DNPH1	O43598	174 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	NDUFB2	O95178	105 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	IGFBP5	P24593	272 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACVR1B	P36896	505 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAP	Q12884	760 aa		11.99	□□□□□ -0.49
UBE2V1-222	ENST00000557021	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49	2e-18	■■■■■ 46.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms