RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	FAM162A	Q96A26	154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TPD52L3	Q96J77	140 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LRR1	Q96L50	414 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NGB	Q9NPG2	151 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NANS	Q9NR45	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LRBA	P50851	2863 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128		A0A1W2PRQ8	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OR5H1	A6NKK0	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CENPBD1	B2RD01	187 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PLPP3	O14495	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ARPC2	O15144	300 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PRSS23	O95084	383 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF682	O95780	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ADA	P00813	363 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SEMG1	P04279	462 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RHCE	P18577	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TNFRSF1B	P20333	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	IGHV1-2	P23083	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MPG	P29372	298 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NTF4	P34130	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MXRA7	P84157	204 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A3	Q00325	362 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DGCR6	Q14129	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TRAM2	Q15035	370 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	AAED1	Q7RTV5	226 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	UEVLD	Q8IX04	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	S100PBP	Q96BU1	408 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MUS81	Q96NY9	551 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CDRT15	Q96T59	188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CACNA1D	Q01668	2161 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PDZD2	O15018	2839 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ENO4	A6NNW6	628 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128		B2RBV5	119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MS4A18	H0YCH9	400 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMCC2	O75069	709 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC43A1	O75387	559 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	THBD	P07204	575 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ITGA5	P08648	1049 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	T-ENOL	P0DO92	83 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NR2C1	P13056	603 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FOSL1	P15407	271 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	EDNRA	P25101	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ADM	P35318	185 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC9A3	P48764	834 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	UGT2B15	P54855	530 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LTB	Q06643	244 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PMS2P3	Q13401	168 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TAF11	Q15544	211 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TAB1	Q15750	504 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LCN8	Q6JVE9	175 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF627	Q7L945	461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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