RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLK3Q9H4B4 646 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGPT4Q9Y264 503 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF212BA8MTL3 300 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSTM5A8MXK1 200 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R3G1 203 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BGLAPP02818 100 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR4A2P43354 598 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPZA2P47755 286 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GZMKP49863 264 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPOXP50336 477 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD17Q5XLA6 110 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCAIQ8N9R8 606 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEX2Q9BXY8 128 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF442Q9H7R0 627 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP22Q9UPT9 525 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPST2O60704 377 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC14L2O76054 403 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFN2O95140 757 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DOBP13765 273 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THBS4P35443 961 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH12P55289 794 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPRL3Q12980 569 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMS2P3Q13401 168 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDP1Q86V88 176 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC6Q9BV81 110 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB1BQ9H0U4 201 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPR2P20594 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTMPQ5BVD1 217 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMYD1Q8NB12 490 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf65Q8NCR3 313 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRR1Q96L50 414 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM43Q9BTV4 400 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35F4A4IF30 521 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PUDPQ08623 228 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNDC15Q96J42 360 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED29Q9NX70 200 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF726A6NNF4 738 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRN3E7EW58 273 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMX1BO60663 402 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP4Q09028 425 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP51A1Q16850 503 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA21Q7Z572 469 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTOV1Q86YD1 416 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SVOPLQ8N434 492 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCHR1Q99705 422 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R3H8 397 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPP3O14495 311 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMO6PO60774 539 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-HP01893 362 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAG1Q14118 895 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF613Q6PF04 617 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXKQ7Z7A4 578 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STON2Q8WXE9 905 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM158Q8WZ71 300 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOK1Q99704 481 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGDIGQ99819 225 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GNT2Q9NY97 397 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms