RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TEX37Q96LM6 180 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 RLIMQ9NVW2 624 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 FAAHO00519 579 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 TCF21O43680 179 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 PF4P02776 101 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 DAOP14920 347 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 IL12AP29459 219 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 TGFBR3Q03167 851 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 RIN1Q13671 783 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA21Q7Z572 469 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.65□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.65□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF432O94892 652 aa5.64□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 TESCQ96BS2 214 aa5.64□□□□□ -1.51
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HOXD8-202ENST00000429017 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 DPY30Q9C005 99 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 NOX3Q9HBY0 568 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD8-202ENST00000429017 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.64□□□□□ -1.51
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