RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 LIPGQ9Y5X9 500 aa10.29□□□□□ -0.76
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CAPNS1-209ENST00000590049 C17orf51A8MQB3 221 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 FFAR1O14842 300 aa10.28□□□□□ -0.76
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CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM109AQ8N4B1 249 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 CBR4Q8N4T8 237 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF611Q8N823 705 aa10.26□□□□□ -0.77
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