RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CR1P17927 2039 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SCDO00767 359 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PIP5K1CO60331 668 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CRLF1O75462 422 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ANXA8P13928 327 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TBXA2RP21731 343 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MYF6P23409 242 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 POU1F1P28069 291 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ELK4P28324 431 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KRT20P35900 424 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SIRPAP78324 504 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ST3GAL3Q11203 375 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 BCL2A1Q16548 175 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CADM2Q8N3J6 435 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC22A20A6NK97 555 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 H0YAE9 185 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 H0YC42 278 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 C16orf97H3BN30 126 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 FAAHO00519 579 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SCO2O43819 266 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 LYPD3O95274 346 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SOX14O95416 240 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 THBDP07204 575 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 DPP4P27487 766 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CHN2P52757 468 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 RAD23AP54725 363 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GAS1P54826 345 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM11AP58511 58 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAM2Q15035 370 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KRT80Q6KB66 452 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF138Q8WVD3 245 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1B0GWA3 101 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC16A6O15403 523 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 KLF4O43474 513 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 OR5F1O95221 314 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PLAUP00749 431 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PAX1P15863 534 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 FUT1P19526 365 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 CCR4P51679 360 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PNLIPRP2P54317 469 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 NR1H2P55055 460 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TTC23Q5W5X9 447 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 OR2A2Q6IF42 318 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 NRMQ8IXM6 262 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF786Q8N393 782 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PFN4Q8NHR9 129 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC38A4Q969I6 547 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TMCO6Q96DC7 493 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 DKKL1Q9UK85 242 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 CADP27708 2225 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 M0R129 80 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 NDUFB5O43674 189 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 FADS1O60427 444 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 LINGO3P0C6S8 592 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PEPDP12955 493 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ISL1P61371 349 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF117Q03924 483 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 SKP2Q13309 424 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TNK1Q13470 666 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 RFX4Q33E94 735 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-204ENST00000558376 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms