RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476543.1

AC108729.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC108729.2, Length 840 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC108729.2-201ENST00000476543 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.61□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ATP10AO60312 1499 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 BTBD17A6NE02 478 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF861PO60384 105 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ACTR3P61158 418 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PEX26Q7Z412 305 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 MYDGFQ969H8 173 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 FBXO32Q969P5 355 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 PLIN2Q99541 437 aa3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 SLC31A2O15432 143 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 SOX15O60248 233 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 MGRN1O60291 552 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 MMP1P03956 469 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 C2P06681 752 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 CRISP2P16562 243 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 CCNE1P24864 410 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 NUDT1P36639 197 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 CRYBB2P43320 205 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 SLC34A3Q8N130 599 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 RNF138Q8WVD3 245 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 FAM210BQ96KR6 192 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.59□□□□□ -1.83
AC108729.2-201ENST00000476543 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 A0A0G2JN53 185 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 C12orf77C9JDV5 145 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 OR7A10O76100 309 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 SERPINA3P01011 423 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF853P0CG23 659 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ETS2P15036 469 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF17P17021 662 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 IFNA8P32881 189 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CTRLP40313 264 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 VHLP40337 213 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 UGT2B15P54855 530 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF77Q15935 545 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 H2AFVQ71UI9 128 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 MKXQ8IYA7 352 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CEP112Q8N8E3 955 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 FGF14Q92915 247 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 SMARCD2Q92925 531 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 HSFY1Q96LI6 401 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 PANX2Q96RD6 677 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 FMO2Q99518 471 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 SORT1Q99523 831 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 TCHPQ9BT92 498 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 LY9Q9HBG7 655 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CALYQ9NYX4 217 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CACNG2Q9Y698 323 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ATRXP46100 2492 aa3.58□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 A0A1W2PPE3 182 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 PSTPIP1O43586 416 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 SNX4O95219 450 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 CASP14P31944 242 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RORAP35398 523 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 LRRC74AQ0VAA2 488 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 GPNMBQ14956 572 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 PPP1R7Q15435 360 aa3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
AC108729.2-201ENST00000476543 UQCC3Q6UW78 93 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms