RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CGREF1	Q99674	301 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR35	Q9HC97	309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R3H8	397 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC43A1	O75387	559 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SASH3	O75995	380 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	KRT33A	O76009	404 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LY6H	O94772	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CELA3B	P08861	270 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CD247	P20963	164 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CBL	P22681	906 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC6A2	P23975	617 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	GZMM	P51124	257 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MTPN	P58546	118 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	DSCR9	P59020	149 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	HGFAC	Q04756	655 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RBBP4	Q09028	425 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	FXYD1	O00168	92 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	FBP2	O00757	339 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	FMO6P	O60774	539 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	OPN1SW	P03999	348 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	EFNA4	P52798	201 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB35	Q15286	201 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	NOX3	Q9HBY0	568 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CRLF2	Q9HC73	371 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CA10	Q9NS85	328 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	MED29	Q9NX70	200 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464		M0QX08	132 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	PLPP3	O14495	311 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CHP2	O43745	196 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SERPINB7	O75635	380 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC14L2	O76054	403 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	PDE5A	O76074	875 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	C8B	P07358	591 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	CBR1	P16152	277 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A16	P16260	332 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-211	ENST00000467464	PAX7	P23759	505 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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