RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ANKFN1Q8N957 763 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM45BQ96B21 275 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 BOD1Q96IK1 185 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 APOPT1Q96IL0 206 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PLK3Q9H4B4 646 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MKS1Q9NXB0 559 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MID2Q9UJV3 735 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 TYROBPO43914 113 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 TRIP10Q15642 601 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK11Q15759 364 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EFNB3Q15768 340 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 VHLLQ6RSH7 139 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 AAED1Q7RTV5 226 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 POLE3Q9NRF9 147 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CA10Q9NS85 328 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EXD2Q9NVH0 621 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ASIC5Q9NY37 505 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP7Q9Y680 259 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AGAP5A6NIR3 686 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AQP7P3A6NL99 342 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 B9A039 149 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV1-44P01699 117 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TACSTD2P09758 323 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GKN3PP0CG01 181 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LYNX1P0DP58 116 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 GIFP27352 417 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 THBS4P35443 961 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 RUNX1T1Q06455 604 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 MPP2Q14168 576 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SQLEQ14534 574 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR7A5Q15622 319 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GPAT3Q53EU6 434 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ATG16L1Q676U5 607 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.66□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 DDIT4LQ96D03 193 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 NEURL3Q96EH8 262 aa5.66□□□□□ -1.5
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