RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	AZIN1	O14977	448 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LGI1	O95970	557 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	AK1	P00568	194 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRA2A	P08913	450 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMP1	P11279	417 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	BCKDHA	P12694	445 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MATN1	P21941	496 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	THBS4	P35443	961 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	HILS1	P60008	231 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF141	Q15928	474 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	AWAT1	Q58HT5	328 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DEF8	Q6ZN54	512 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GPAT4	Q86UL3	456 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51F2	Q8NH61	342 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SFXN5	Q8TD22	340 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	EXD2	Q9NVH0	621 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FCMR	O60667	390 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN2B	O60939	215 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B17	O75795	530 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL10	O95999	233 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MSMB	P08118	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CECR9	P0C854	216 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR3A	P46098	478 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	HPCA	P84074	193 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LSAMP	Q13449	338 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	RIN1	Q13671	783 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A1	Q14916	467 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR31	Q5SQ13	230 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N1Y9	231 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NATD1	Q8N6N6	113 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP37	Q8NFH4	326 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T11	Q8NH01	316 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PMM1	Q92871	262 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM45B	Q96B21	275 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL1	Q96LA6	429 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511		X6R8D5	127 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V2L1	256 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NR5A2	O00482	541 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRA3	O75311	464 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TF	P02787	698 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CALCR	P30988	508 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PGM1	P36871	562 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPZA2	P47755	286 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KHK	P50053	298 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NPRL3	Q12980	569 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM225	Q6GV28	225 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	USP43	Q70EL4	1123 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK20	Q8IZL9	346 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DOK1	Q99704	481 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TREM2	Q9NZC2	230 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TBK1	Q9UHD2	729 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CMAHP	Q9Y471	501 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR45	Q9Y484	360 aa		9.34	□□□□□ -0.91

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