RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TIGARQ9NQ88 270 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 NANSQ9NR45 359 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ACACBO00763 2458 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR14I1A6ND48 311 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZIC3O60481 467 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR7A10O76100 309 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PMS2P2O95744 297 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 IGHG3P01860 377 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2ABP04908 130 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ALPLP05186 524 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CBLP22681 906 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SFTPDP35247 375 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 GPR4P46093 362 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 IL1RL1Q01638 556 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TSPAN31Q12999 210 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SEC23BQ15437 767 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 BCL2A1Q16548 175 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF74Q16587 644 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 LPCAT4Q643R3 524 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 GHDCQ8N2G8 530 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SCAIQ8N9R8 606 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PFN4Q8NHR9 129 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 POC1BQ8TC44 478 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SARAFQ96BY9 339 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR5B2Q96R09 309 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 UCK2Q9BZX2 261 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 MGAQ8IWI9 3026 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 UNC119BA6NIH7 251 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 H0YJX3 145 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 H3BN98 237 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 K7EM74 188 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PDLIM1O00151 329 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SOCS2O14508 198 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 AQP7O14520 342 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SEC14L5O43304 696 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PIP5K1CO60331 668 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 NPIPB7O75200 414 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 RCBTB2O95199 551 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR6A2O95222 327 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 WNT11O96014 354 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 FCGR2AP12318 317 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 BMP7P18075 431 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PTNP21246 168 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OMPP47874 163 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PRPS1P60891 318 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ESRRGP62508 458 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SLC35A1P78382 337 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 MYBPHQ13203 477 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 NADK2Q4G0N4 442 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 WLSQ5T9L3 541 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TRILQ7L0X0 811 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OAFQ86UD1 273 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.72□□□□□ -1.01
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms