RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A1Q14916 467 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.69□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 GRINAQ7Z429 371 aa5.69□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 CHRM4P08173 479 aa5.67□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 MPGP29372 298 aa5.67□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 P2RY4P51582 365 aa5.67□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 TUBA1BP68363 451 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TUBA4AP68366 448 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 HGFACQ04756 655 aa5.67□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 SYPL1Q16563 259 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SAXO2Q658L1 398 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TUBA1AQ71U36 451 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 NATD1Q8N6N6 113 aa5.67□□□□□ -1.5
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