RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	AKR7A3	O95154	331 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PMS2P2	O95744	297 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	BAG2	O95816	211 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	BGLAP	P02818	100 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	MAK	P20794	623 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ENPP1	P22413	925 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	GRPR	P30550	384 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	HMGA2	P52926	109 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RAC3	P60763	192 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SGTB	Q96EQ0	304 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	OR2T1	O43869	369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CCNB2	O95067	398 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	TGM6	O95932	706 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FCGR1A	P12314	374 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ACVR2A	P27037	513 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PRKCD	Q05655	676 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF74	Q16587	644 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153		M0R082	166 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RAMP1	O60894	148 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR1	O75083	606 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	AQP8	O94778	261 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SYNGR4	O95473	234 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	POU2F1	P14859	743 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	GABRA1	P14867	456 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PRKACG	P22612	351 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC35A1	P78382	337 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	RCN1	Q15293	331 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	MICA	Q29983	383 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	KDM8	Q8N371	416 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	GPA33	Q99795	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	NANS	Q9NR45	359 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CDC42EP2	O14613	210 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	OR7A10	O76100	309 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF23	P17027	643 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	OMP	P47874	163 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CTBP2	P56545	445 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	NUP107	P57740	925 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SUMO3-206	ENST00000479153	CDK20	Q8IZL9	346 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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