RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.93□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.93□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.93□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 TMEM80Q96HE8 168 aa4.93□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 TBX15Q96SF7 602 aa4.93□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.93□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 NUDT15Q9NV35 164 aa4.93□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 UMPSP11172 480 aa4.92□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.92□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 STK38Q15208 465 aa4.91□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
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MDM2-201ENST00000258148 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 CCNB3Q8WWL7 1395 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM2-201ENST00000258148 USP47Q96K76 1375 aa4.91□□□□□ -1.62
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