RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.54■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GNAI2P04899 355 aa24.54■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SRGNP10124 158 aa24.54■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.54■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DPEP1P16444 411 aa24.53■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TGFB2P61812 414 aa24.53■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.53■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.53■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF1P21675 1872 aa24.52■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 H0YIN7 160 aa24.52■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSF1RP07333 972 aa24.52■■□□□ 1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNA3P22001 575 aa24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYT17Q9BSW7 474 aa24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GREM2Q9H772 168 aa24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.51■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.5■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.5■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM161AQ3B820 660 aa24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MASTLQ96GX5 879 aa24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL4A1P02462 1669 aa24.48■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NPR1P16066 1061 aa24.48■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.48■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CACNA1SQ13698 1873 aa24.48■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITGA6P23229 1130 aa24.47■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STYK1Q6J9G0 422 aa24.46■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RTL9Q8NET4 1388 aa24.44■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.44■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP85Q6P2H3 762 aa24.44■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.44■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLX4Q8IY92 1834 aa24.43■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.43■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIM2Q9P1W9 311 aa24.43■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SRGAP3O43295 1099 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ALDH1B1P30837 517 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MTX1Q13505 466 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRAPQ13588 217 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPEF2Q9C093 1822 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP8B2P98198 1209 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC51AQ86UW1 340 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNKSR1Q969H4 720 aa24.42■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTLL6Q8N841 843 aa24.41■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.41■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.41■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.4■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.4■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UTRNP46939 3433 aa24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCS1LQ9Y276 419 aa24.38■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BBOX1O75936 387 aa24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEFLP07196 543 aa24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POLA2Q14181 598 aa24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OLFM4Q6UX06 510 aa24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SSH3Q8TE77 659 aa24.37■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C21orf2O43822 256 aa24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AAMPQ13685 434 aa24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIL1Q9H173 461 aa24.35■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.34■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC24Q50LG9 513 aa24.33■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COPRSQ9NQ92 184 aa24.33■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.33■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.32■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.32■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SP8Q8IXZ3 490 aa24.31■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.31■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms