RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	MYD88	Q99836	296 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	SCN4A	P35499	1836 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	CCDC27	Q2M243	656 aa		28	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	JMY	Q8N9B5	988 aa		28	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	COL4A5	P29400	1685 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	STK31	Q9BXU1	1019 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CIPC-208	ENST00000557115	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	LAMB2	P55268	1798 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	EPS15	P42566	896 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	SCNN1D	P51172	638 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	CXCL9	Q07325	125 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	IL16	Q14005	1332 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	KSR2	Q6VAB6	950 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	RAD17	O75943	681 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	TNIP1	Q15025	636 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIPC-208	ENST00000557115	PDE8A	O60658	829 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	SLC4A2	P04920	1241 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	GPSM2	P81274	684 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	TAF1	P21675	1872 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	EYA3	Q99504	573 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIPC-208	ENST00000557115	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	IGKV5-2	P06315	115 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	G2E3	Q7L622	706 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115		G3V3G9	751 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	FLII	Q13045	1269 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115		H7C1D1	291 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	UFL1	O94874	794 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CTSW	P56202	376 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04

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