RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477		H7C1W4	665 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	CTSW	P56202	376 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	NPR1	P16066	1061 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PDE8A	O60658	829 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.71	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.71	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PRELP	P51888	382 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	FOXO4	P98177	505 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	COL4A5	P29400	1685 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	NFKBIE	O00221	500 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ITGA6	P23229	1130 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SNAP23	O00161	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	GRAP	Q13588	217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	UTY	O14607	1347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	SIL1	Q9H173	461 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	CSF1R	P07333	972 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MLH1-222	ENST00000539477	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	TAF5L	O75529	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	KLRK1	P26718	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	GPSM2	P81274	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	AOC3	Q16853	763 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MLH1-222	ENST00000539477	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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