RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536283.1

ARF3-205, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ARF3, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-205ENST00000536283 LDHDQ86WU2 507 aa28.59■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.59■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 EPHX2P34913 555 aa28.58■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 MPNDQ8N594 471 aa28.58■■■□□ 2.17
ARF3-205ENST00000536283 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.57■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 IL16Q14005 1332 aa28.57■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 TMC4Q7Z404 712 aa28.56■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 VPS33BQ9H267 617 aa28.56■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.55■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 STK31Q9BXU1 1019 aa28.55■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.54■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.54■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 LTBP1Q14766 1721 aa28.53■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 COL4A1P02462 1669 aa28.53■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.52■■■□□ 2.16
ARF3-205ENST00000536283 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.51■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 JMYQ8N9B5 988 aa28.51■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.51■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.5■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 SCNN1DP51172 638 aa28.5■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 KSR2Q6VAB6 950 aa28.49■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 PASKQ96RG2 1323 aa28.48■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.48■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.48■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 CREBZFQ9NS37 354 aa28.48■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 EPS15P42566 896 aa28.47■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 WDR63Q8IWG1 891 aa28.47■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.47■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 CXCL9Q07325 125 aa28.46■■■□□ 2.15
ARF3-205ENST00000536283 PDE8AO60658 829 aa28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 SLC4A2P04920 1241 aa28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 G2E3Q7L622 706 aa28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.45■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 IGKV5-2P06315 115 aa28.44■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 GPSM2P81274 684 aa28.44■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.44■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.44■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CNTROBQ8N137 903 aa28.43■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.43■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 C6orf229H3BNL8 230 aa28.42■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 RAD17O75943 681 aa28.42■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 WASHC4Q2M389 1173 aa28.42■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.42■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 FLIIQ13045 1269 aa28.41■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 TNIP1Q15025 636 aa28.4■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 POLLQ9UGP5 575 aa28.4■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 YDJCA8MPS7 323 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 RIMBP2O15034 1052 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 EYA3Q99504 573 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
ARF3-205ENST00000536283 VAMP4O75379 141 aa28.38■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 CTSWP56202 376 aa28.38■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.38■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.38■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 MYH3P11055 1940 aa28.37■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 CACNA1FO60840 1977 aa28.37■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.36■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.36■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.36■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 CNTNAP1P78357 1384 aa28.36■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.35■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 UFL1O94874 794 aa28.34■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.34■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.34■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 ECE2O60344 883 aa28.33■■■□□ 2.13
ARF3-205ENST00000536283 DOK7Q18PE1 504 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms