RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527446.5

RPS3-209, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS3, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-209ENST00000527446 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 LRP5O75197 1615 aa15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 KCNA3P22001 575 aa15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 MTX1Q13505 466 aa15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 RTL9Q8NET4 1388 aa15.98■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 CHRNA5P30532 468 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 TGFB2P61812 414 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 GREM2Q9H772 168 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 COL4A1P02462 1669 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 TAF1P21675 1872 aa15.97■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 ATP8B2P98198 1209 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 AAMPQ13685 434 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 FAM161AQ3B820 660 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 CEP85Q6P2H3 762 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.96■□□□□ 0.15
RPS3-209ENST00000527446 A0A0G2JLW4 131 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 DPEP1P16444 411 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.95■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 H0YIN7 160 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 NPR1P16066 1061 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 POLA2Q14181 598 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 STYK1Q6J9G0 422 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 MASTLQ96GX5 879 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 ITGA6P23229 1130 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SSH3Q8TE77 659 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SYT17Q9BSW7 474 aa15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SRGAP3O43295 1099 aa15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 GRAPQ13588 217 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 KLHL34Q8N239 644 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.92■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SLX4Q8IY92 1834 aa15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 BBOX1O75936 387 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 NEFLP07196 543 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 ALDH1B1P30837 517 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 SLC51AQ86UW1 340 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 CNKSR1Q969H4 720 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 COPRSQ9NQ92 184 aa15.9■□□□□ 0.14
RPS3-209ENST00000527446 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 TTLL6Q8N841 843 aa15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 PIM2Q9P1W9 311 aa15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 CACNA1SQ13698 1873 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 SPEF2Q9C093 1822 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 EYA2O00167 538 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 CIAO1O76071 339 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 IGHDP01880 384 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 LRRC24Q50LG9 513 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 OLFM4Q6UX06 510 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 SP8Q8IXZ3 490 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 FBXO3Q9UK99 471 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 SNED1Q8TER0 1413 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 HMMRO75330 724 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-209ENST00000527446 TMC4Q7Z404 712 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms