RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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TSPAN4-216ENST00000526055 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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TSPAN4-216ENST00000526055 POTECB2RU33 542 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSPAN4-216ENST00000526055 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSPAN4-216ENST00000526055 E9PSI1 815 aa23.55■■□□□ 1.36
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TSPAN4-216ENST00000526055 PPIP5K2O43314 1243 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.52■■□□□ 1.36
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TSPAN4-216ENST00000526055 AOC3Q16853 763 aa23.51■■□□□ 1.35
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TSPAN4-216ENST00000526055 COL4A5P29400 1685 aa23.5■■□□□ 1.35
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TSPAN4-216ENST00000526055 SLFN5Q08AF3 891 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-216ENST00000526055 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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TSPAN4-216ENST00000526055 TAF1P21675 1872 aa23.47■■□□□ 1.35
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TSPAN4-216ENST00000526055 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.45■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 WASHC4Q2M389 1173 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 BEND3Q5T5X7 828 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.45■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 F6X3S4 739 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 TNIP1Q15025 636 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 POLLQ9UGP5 575 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 COL4A1P02462 1669 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH3P11055 1940 aa23.42■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 ALDH1L1O75891 902 aa23.42■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.41■■□□□ 1.34
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TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRCP08575 1304 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 XDHP47989 1333 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-216ENST00000526055 POTEIP0CG38 1075 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-216ENST00000526055 POTEJP0CG39 1038 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-216ENST00000526055 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-216ENST00000526055 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-216ENST00000526055 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-216ENST00000526055 UFL1O94874 794 aa23.38■■□□□ 1.33
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