RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 DPEP1P16444 411 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH1B1P30837 517 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 CNKSR1Q969H4 720 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 CHRNA5P30532 468 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 PIM2Q9P1W9 311 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 COG6Q9Y2V7 657 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 TAF1P21675 1872 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SUCLG2Q96I99 432 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLX4Q8IY92 1834 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0G2JLW4 131 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 CSF1RP07333 972 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 GNAI2P04899 355 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 KCNA3P22001 575 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 FOXO4P98177 505 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 TTLL6Q8N841 843 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 TMC4Q7Z404 712 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 KAZALD1Q96I82 304 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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PTPRK-218ENST00000525459 GRAPQ13588 217 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPRK-218ENST00000525459 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 AAMPQ13685 434 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 BBOX1O75936 387 aa23.39■■□□□ 1.34
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PTPRK-218ENST00000525459 MTX1Q13505 466 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 FAM161AQ3B820 660 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 GREM2Q9H772 168 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GUL6 1792 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 ITGA6P23229 1130 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 SOGA3Q5TF21 947 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPRK-218ENST00000525459 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRK-218ENST00000525459 COL4A1P02462 1669 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 LTBP1Q14766 1721 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 CRBNQ96SW2 442 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRK-218ENST00000525459 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SRGAP3O43295 1099 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SP8Q8IXZ3 490 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO3Q9UK99 471 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC93Q567U6 631 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 CEP85Q6P2H3 762 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 GRIN3BO60391 1043 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 HMMRO75330 724 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 ATP8B2P98198 1209 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 GPR162Q16538 588 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SNED1Q8TER0 1413 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 C21orf2O43822 256 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SSH3Q8TE77 659 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 COPRSQ9NQ92 184 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SBF1O95248 1867 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRK-218ENST00000525459 POLA2Q14181 598 aa23.27■■□□□ 1.32
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