RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLR1Q15399 786 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRN4Q8WUT4 740 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLPIP03973 132 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CELA3BP08861 270 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUT4P22083 530 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGA2P52926 109 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 PERM1Q5SV97 790 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CIAPIN1Q6FI81 312 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR23BQ6ZRT6 265 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC125Q86Z20 511 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC9Q92623 222 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BHMTQ93088 406 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP41Q9BYV8 373 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIMD1Q9UGP4 676 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP3Q9Y6I4 520 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFIBO00712 420 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP26A1O43174 497 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED14OSP0DP75 135 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMP3P12645 472 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMP7P18075 431 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEUROD1Q13562 356 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSWIM9Q86XI8 627 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FLAD1Q8NFF5 587 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 XYLT2Q9H1B5 865 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG3Q9NT62 314 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRRDQ9UH36 339 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJA3Q9Y6H8 435 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS20P59510 1910 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB42B2RXF5 422 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM13O60858 407 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TATP17735 454 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXLNAP40222 546 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 PREPP48147 710 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUSC1Q2TAM9 212 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBPF1Q3BBV0 1214 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRCH2Q5VUJ6 765 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL6Q8N531 539 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNT11Q8NCW6 608 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNK4Q9NYG8 393 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MATN3O15232 486 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADMP35318 185 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00310P59036 64 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATS1Q496A3 300 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM35AQ86V20 835 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPS8L1Q8TE68 723 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 GATA6Q92908 595 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEGAINQ9BUH8 593 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNF1Q9H3M0 494 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGFLR1Q9H665 355 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC5A6Q9Y289 635 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUAK1O60285 661 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPB1P15086 417 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESCO1Q5FWF5 840 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG14Q6ZNE5 492 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACAD11Q709F0 780 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPIHBP1Q8IV16 184 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA6CQ9H3T2 930 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIF3AQ9Y2N7 669 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 EML1O00423 815 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FSHBP01225 129 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD8BP10966 210 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCNN1DP51172 638 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 TYRO3Q06418 890 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BNIP3Q12983 259 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNMB1Q16558 191 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRIQ9BWK5 157 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAM19Q9H013 955 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRD7Q9NPI1 651 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNH4Q9UQ05 1017 aa1.91□□□□□ -2.1
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM170BA6NMN3 283 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGO2Q562F6 1265 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE1EQ5T753 118 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF20Q5VTR2 975 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 FYB2Q5VWT5 728 aa1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152.1 ms