RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF428Q96B54 188 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC51AQ86UW1 340 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM89AQ96GI7 184 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT57Q9NWB7 429 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL9Q07325 125 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA2Q08379 1002 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 TNIP1Q15025 636 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 AIDAQ96BJ3 306 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 VEGFBP49765 207 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 COL4A5P29400 1685 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF853P0CG23 659 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 RASSF10A6NK89 507 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 WASHC4Q2M389 1173 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPN15O75808 1086 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD17O75943 681 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf229H3BNL8 230 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMB2P55268 1798 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 EYA3Q99504 573 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 MYD88Q99836 296 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 H7C1D1 291 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXN1O15353 648 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMBP2O15034 1052 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 ECE1P42892 770 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 LTBP1Q14766 1721 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 G3V3G9 751 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAF5O00463 557 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 WBP1LQ9NX94 342 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 GPSM2P81274 684 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 YDJCA8MPS7 323 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 GRM1Q13255 1194 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 STK31Q9BXU1 1019 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF1P21675 1872 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE8AO60658 829 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CST9Q5W186 159 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 DPF2Q92785 391 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 POLLQ9UGP5 575 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 MICALL2Q8IY33 904 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPNS2Q96L46 248 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMD14O00487 310 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 DOK7Q18PE1 504 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ECE2O60344 883 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 KSR2Q6VAB6 950 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.76■■□□□ 1.55
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