RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SCN4AP35499 1836 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 FZD9O00144 591 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 COL4A5P29400 1685 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 APLP1P51693 650 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 TMC4Q7Z404 712 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 FLIIQ13045 1269 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 MPNDQ8N594 471 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 PPIP5K2O43314 1243 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV5-2P06315 115 aa21.43■■□□□ 1.02
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SH3BP4-211ENST00000493436 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE8AO60658 829 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 NIM1KQ8IY84 436 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 VPS33BQ9H267 617 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 MYH3P11055 1940 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 COL4A1P02462 1669 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF521Q96K83 1311 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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SH3BP4-211ENST00000493436 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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SH3BP4-211ENST00000493436 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 HACL1Q9UJ83 578 aa21.39■■□□□ 1.01
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SH3BP4-211ENST00000493436 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP350Q5VT06 3117 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 EPHX2P34913 555 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 CTSWP56202 376 aa21.35■■□□□ 1.01
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SH3BP4-211ENST00000493436 LDHDQ86WU2 507 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 LINS1Q8NG48 757 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 LTBP1Q14766 1721 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 F6X3S4 739 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 C6orf229H3BNL8 230 aa21.33■■□□□ 1.01
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SH3BP4-211ENST00000493436 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 POLLQ9UGP5 575 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 SPEF2Q9C093 1822 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 E9PSI1 815 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 CXCL9Q07325 125 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 WASHC4Q2M389 1173 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 SCNN1DP51172 638 aa21.31■■□□□ 1
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SH3BP4-211ENST00000493436 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.31■■□□□ 1
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SH3BP4-211ENST00000493436 GREM2Q9H772 168 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP4-211ENST00000493436 TNIP1Q15025 636 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 BEND3Q5T5X7 828 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL9Q8NET4 1388 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 YDJCA8MPS7 323 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 GGA1Q9UJY5 639 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP4-211ENST00000493436 UFL1O94874 794 aa21.27■■□□□ 1
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