RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		22.17	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MPND	Q8N594	471 aa		22.17	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	22.17	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HACL1	Q9UJ83	578 aa		22.17	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		22.15	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LDHD	Q86WU2	507 aa		22.15	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MYD88	Q99836	296 aa		22.15	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		22.14	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		22.14	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		22.14	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	NIM1K	Q8IY84	436 aa		22.14	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		22.14	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		22.14	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN4A	P35499	1836 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIP5K2	O43314	1243 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE8A	O60658	829 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A2	P04920	1241 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	22.13	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP4	O75379	141 aa		22.12	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		22.12	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMB2	P55268	1798 aa		22.12	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHX2	P34913	555 aa		22.1	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRG1	Q96E93	195 aa		22.1	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		22.1	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV5-2	P06315	115 aa		22.09	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FLII	Q13045	1269 aa		22.09	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	JMY	Q8N9B5	988 aa		22.09	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	22.09	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF1	P21675	1872 aa		22.09	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	22.08	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TNIP1	Q15025	636 aa		22.08	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	AOC3	Q16853	763 aa		22.08	■■□□□ 1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF521	Q96K83	1311 aa		22.07	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	22.07	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC51A	Q86UW1	340 aa		22.07	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EYA3	Q99504	573 aa		22.07	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C1W4	665 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LINS1	Q8NG48	757 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CREBZF	Q9NS37	354 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL9	Q8NET4	1388 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PASK	Q96RG2	1323 aa		22.06	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A5	P29400	1685 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEI	P0CG38	1075 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEJ	P0CG39	1038 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SCNN1D	P51172	638 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL9	Q07325	125 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	WASHC4	Q2M389	1173 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	22.05	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	G2E3	Q7L622	706 aa		22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF428	Q96B54	188 aa		22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		22.04	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSW	P56202	376 aa		22.03	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	22.03	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GCKR	Q14397	625 aa		22.03	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		22.03	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		22.02	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DPF2	Q92785	391 aa		22.02	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	22.02	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		22.02	■■□□□ 1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1F	O60840	1977 aa		22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	POLL	Q9UGP5	575 aa		22.01	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf229	H3BNL8	230 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GPSM2	P81274	684 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTROB	Q8N137	903 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		22	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PSI1	815 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	EPS15	P42566	896 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP7	P55210	303 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GGA1	Q9UJY5	639 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	XDH	P47989	1333 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		21.99	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		21.99	■■□□□ 1.11

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