RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC4O15439 1325 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTNAP1P78357 1384 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 FLIIQ13045 1269 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 PASKQ96RG2 1323 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 TAF1P21675 1872 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 PSMD1Q99460 953 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 E9PSI1 815 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
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SH3BP4-205ENST00000444916 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 GRAPQ13588 217 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 BBOX1O75936 387 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV5-2P06315 115 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 LDHDQ86WU2 507 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC51AQ86UW1 340 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 SLFN5Q08AF3 891 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 MIER1Q8N108 512 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 SCN4AP35499 1836 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 MYH3P11055 1940 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 PDE8AO60658 829 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 LBX1P52954 281 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 TMC4Q7Z404 712 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 SP8Q8IXZ3 490 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 AIDAQ96BJ3 306 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 COL4A1P02462 1669 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 LINS1Q8NG48 757 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 WBP1LQ9NX94 342 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 COL4A5P29400 1685 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 GCKRQ14397 625 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 JDP2Q8WYK2 163 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-205ENST00000444916 F6X3S4 739 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 H7C1W4 665 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 FZD9O00144 591 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 EPHX2P34913 555 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 MPNDQ8N594 471 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 HACL1Q9UJ83 578 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 CTSWP56202 376 aa18■□□□□ 0.47
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SH3BP4-205ENST00000444916 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 VPS33BQ9H267 617 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 LTBP1Q14766 1721 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIP5K2O43314 1243 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTROBQ8N137 903 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 RASSF10A6NK89 507 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 BEND3Q5T5X7 828 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 RTL9Q8NET4 1388 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 CASP7P55210 303 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 AOC3Q16853 763 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 NIM1KQ8IY84 436 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.97■□□□□ 0.47
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