RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PDE3A	Q14432	1141 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UTY	O14607	1347 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CTSW	P56202	376 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ALDH1B1	P30837	517 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RLBP1	P12271	317 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC51A	Q86UW1	340 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPEF2	Q9C093	1822 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C21orf2	O43822	256 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FOXO4	P98177	505 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SUCLG2	Q96I99	432 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	OLFM4	Q6UX06	510 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GRAP	Q13588	217 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GREM2	Q9H772	168 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CSF1R	P07333	972 aa		29	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MEIS3	Q99687	375 aa		29	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHD4	Q14839	1912 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GNAI3	P08754	354 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM161A	Q3B820	660 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RTL9	Q8NET4	1388 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SBF1	O95248	1867 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BBOX1	O75936	387 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SNED1	Q8TER0	1413 aa		28.95	■■■□□ 2.23
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RASSF7	Q02833	373 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ITGA6	P23229	1130 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NFKBIE	O00221	500 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRELP	P51888	382 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UTRN	P46939	3433 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GNAI2	P04899	355 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GPSM2	P81274	684 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MPND	Q8N594	471 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CRBN	Q96SW2	442 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PSMD1	Q99460	953 aa		28.82	■■■□□ 2.2

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