RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417835.1

FGD5-AS1-201, FGD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FGD5-AS1, Length 1,630 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5-AS1-201ENST00000417835 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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FGD5-AS1-201ENST00000417835 NTSR2O95665 410 aa29■■■□□ 2.23
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FGD5-AS1-201ENST00000417835 TTLL11Q8NHH1 800 aa29■■■□□ 2.23
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FGD5-AS1-201ENST00000417835 SPEF2Q9C093 1822 aa28.85■■■□□ 2.21
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FGD5-AS1-201ENST00000417835 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.82■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 MSH5O43196 834 aa28.81■■■□□ 2.2
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FGD5-AS1-201ENST00000417835 USP26Q9BXU7 913 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 A0A1B0GUL6 1792 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 APBA3O96018 575 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 METTL24Q5JXM2 366 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.8■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.79■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.79■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 TIMM10P62072 90 aa28.78■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
FGD5-AS1-201ENST00000417835 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.77■■■□□ 2.2
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